Конституции Российской Федерации закрепляет, что защита Отечества является долгом и обязанностью гражданина Российской Федерации.

Статья 15 Федерального закона от 15.08.1996 № 114-ФЗ «О порядке выезда из Российской Федерации и въезда в Российскую Федерацию» устанавливает случаи, при которых право гражданина Российской Федерации на выезд из Российской Федерации может быть временно ограничено. В частности к ним отнесено призвание гражданина на военную службу или направление на альтернативную гражданскую службу, - до окончания военной службы или альтернативной гражданской службы.

В целях реализации данного положения, Федеральной миграционной службой и Министерством обороны России 15 апреля 2011 года издан совместный приказ № 507 «Об утверждении Инструкции о порядке взаимодействия ФМС России, территориальных органов ФМС России и их структурных подразделений с Минобороны России, военными комиссариатами и отделами военных комиссариатов при оформлении гражданам Российской Федерации, подлежащим призыву на военную службу либо направлению на альтернативную гражданскую службу, паспорта гражданина Российской Федерации, удостоверяющего личность гражданина Российской Федерации за пределами территории Российской Федерации».

В соответствии с данной Инструкцией, при обращении в органы ФМС России гражданина, подлежащего призыву на военную службу, либо направлению на альтернативную гражданскую службу, с заявлением о выдаче заграничного паспорта, орган ФМС направляет в отдел военного комиссариата, в котором заявитель состоит на воинском учете, запрос о предоставлении информации о временном ограничении права заявителя на выезд из Российской Федерации, либо об отсутствии такого ограничения.

При поступлении из военкомата информации об ограничении права на выезд паспорт не оформляется и (или) не выдается, а заявителю выдается соответствующее уведомление.

Так как Вы являетесь призывником и обратились в ФМС в период прохождения призывной службы, отказ в выдаче Вам загранпаспорта является законным.